Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtifQ6PEE2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtifQ6PEE2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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