Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Chd4Q6PDQ2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chd4Q6PDQ2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd4Q6PDQ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd4Q6PDQ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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