Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim37Q6PCX9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim37Q6PCX9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim37Q6PCX9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms