Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB90

Pcdhb14, Protocadherin beta-14, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb14Q6PB90 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb14Q6PB90 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb14Q6PB90 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb14Q6PB90 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms