Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Bend3Q6PAL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bend3Q6PAL0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bend3Q6PAL0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms