Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atl2Q6PA06 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atl2Q6PA06 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms