Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PcnpQ6P8I4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PcnpQ6P8I4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnpQ6P8I4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnpQ6P8I4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnpQ6P8I4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnpQ6P8I4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnpQ6P8I4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnpQ6P8I4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PcnpQ6P8I4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms