Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdac10Q6P3E7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdac10Q6P3E7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms