Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A4

Vsig8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig8Q6P3A4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vsig8Q6P3A4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vsig8Q6P3A4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms