Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrig3Q6P1C6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrig3Q6P1C6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrig3Q6P1C6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms