Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asic1Q6NXK8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asic1Q6NXK8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Asic1Q6NXK8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms