Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RragbQ6NTA4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RragbQ6NTA4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RragbQ6NTA4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RragbQ6NTA4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RragbQ6NTA4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RragbQ6NTA4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RragbQ6NTA4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RragbQ6NTA4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RragbQ6NTA4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms