Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Pdcd11Q6NS46 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdcd11Q6NS46 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Pdcd11Q6NS46 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms