Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltbQ6IRU5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CltbQ6IRU5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CltbQ6IRU5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms