Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Carmil1Q6EDY6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Carmil1Q6EDY6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Carmil1Q6EDY6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Carmil1Q6EDY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Carmil1Q6EDY6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms