Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Swap70Q6A028 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Swap70Q6A028 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Swap70Q6A028 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms