Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk13Q69ZA1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk13Q69ZA1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk13Q69ZA1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk13Q69ZA1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk13Q69ZA1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Cdk13Q69ZA1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cdk13Q69ZA1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms