Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ifit1Q64282 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ifit1Q64282 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ifit1Q64282 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms