Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Zfp248Q640N4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp248Q640N4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Zfp248Q640N4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zfp248Q640N4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zfp248Q640N4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zfp248Q640N4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zfp248Q640N4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zfp248Q640N4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp248Q640N4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zfp248Q640N4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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