Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SypQ62277 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SypQ62277 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SypQ62277 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SypQ62277 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SypQ62277 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SypQ62277 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SypQ62277 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SypQ62277 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SypQ62277 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms