Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tgfb1i1Q62219 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tgfb1i1Q62219 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tgfb1i1Q62219 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms