Protein–RNA interactions for Protein: Q62179

Sema4b, Semaphorin-4B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4bQ62179 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sema4bQ62179 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sema4bQ62179 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sema4bQ62179 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms