Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim27Q62158 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim27Q62158 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim27Q62158 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms