Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sin3bQ62141 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sin3bQ62141 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sin3bQ62141 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms