Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Odf1Q61999 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf1Q61999 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf1Q61999 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf1Q61999 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Odf1Q61999 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Odf1Q61999 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf1Q61999 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Odf1Q61999 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Odf1Q61999 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Odf1Q61999 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf1Q61999 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Odf1Q61999 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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