Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ift20Q61025 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ift20Q61025 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms