Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp4Q60972 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rbbp4Q60972 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms