Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Meis1Q60954 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Meis1Q60954 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Meis1Q60954 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms