Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdkn2cQ60772 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdkn2cQ60772 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdkn2cQ60772 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms