Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprnQ60673 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprnQ60673 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtprnQ60673 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms