Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema5bQ60519 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema5bQ60519 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms