Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf15Q5UBV8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms