Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TefmQ5SSK3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TefmQ5SSK3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms