Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Utp18Q5SSI6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Utp18Q5SSI6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Utp18Q5SSI6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms