Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnni3kQ5GIG6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnni3kQ5GIG6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnni3kQ5GIG6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms