Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM61Q5EBN2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM61Q5EBN2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM61Q5EBN2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms