Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Nlrc3Q5DU56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc3Q5DU56 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Nlrc3Q5DU56 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Nlrc3Q5DU56 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Nlrc3Q5DU56 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Nlrc3Q5DU56 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Nlrc3Q5DU56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrc3Q5DU56 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrc3Q5DU56 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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