Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Usp22Q5DU02 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp22Q5DU02 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms