Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx25Q3ZT31 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx25Q3ZT31 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx25Q3ZT31 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms