Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clul1Q3ZRW6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clul1Q3ZRW6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Clul1Q3ZRW6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms