Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc43Q3V0L5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc43Q3V0L5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrc43Q3V0L5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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