Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp48Q3V0C5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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Usp48Q3V0C5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp48Q3V0C5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp48Q3V0C5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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