Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms