Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bbof1Q3V079 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bbof1Q3V079 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bbof1Q3V079 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms