Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UZV7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3UZV7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UZV7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UZV7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UZV7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q3UZV7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms