Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYI5

Rgl3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgl3Q3UYI5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rgl3Q3UYI5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rgl3Q3UYI5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rgl3Q3UYI5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms