Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mbd3l2Q3UXB0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mbd3l2Q3UXB0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms