Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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D130052B06RikQ3UW13 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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D130052B06RikQ3UW13 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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D130052B06RikQ3UW13 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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D130052B06RikQ3UW13 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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D130052B06RikQ3UW13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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D130052B06RikQ3UW13 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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D130052B06RikQ3UW13 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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D130052B06RikQ3UW13 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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D130052B06RikQ3UW13 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
D130052B06RikQ3UW13 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
D130052B06RikQ3UW13 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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