Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slfn4Q3UV66 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slfn4Q3UV66 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms