Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTZ3

Uncharacterized protein C7orf43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UTZ3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q3UTZ3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q3UTZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3UTZ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms