Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS3

Drc1, Dynein regulatory complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc1Q3USS3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Drc1Q3USS3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Drc1Q3USS3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms